Origens do coronavírus: a análise do genoma sugere que dois vírus podem ter se combinado

Imagem via Michal Ico / Unsplash

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No espaço de algumas semanas, todos nós aprendemos muito sobre COVID-19 e o vírus que o causa: SARS-CoV-2. Mas também houve muitos rumores. E, embora o número de artigos científicos sobre esse vírus esteja aumentando, ainda existem muitas áreas nebulosas quanto à sua origem.



Em que espécie animal isso ocorreu? Um morcego, um pangolim ou outra espécie selvagem? De onde isso vem? De uma caverna ou floresta na província chinesa de Hubei ou em outro lugar?

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Em dezembro de 2019, 27 das primeiras 41 pessoas hospitalizadas (66%) passaram por um mercado localizado no coração da cidade de Wuhan, na província de Hubei. Mas, de acordo com um estudo realizado no Hospital Wuhan , o primeiro caso humano identificado não frequentava este mercado. Em vez de, uma estimativa de datação molecular com base nas sequências genômicas SARS-CoV-2 indica uma origem em novembro. Isso levanta questões sobre a ligação entre esta epidemia de COVID-19 e a vida selvagem.



Dados genômicos

O Genoma SARS-CoV-2 foi rapidamente sequenciado por pesquisadores chineses. É um RNA molécula de cerca de 30.000 bases contendo 15 genes, incluindo o gene S que codifica para uma proteína localizada na superfície do envelope viral (para comparação, nosso genoma está na forma de uma dupla hélice de DNA com cerca de 3 bilhões de bases de tamanho e contém cerca de 30.000 genes).

Comparativo análises genômicas mostraram que SARS-CoV-2 pertence ao grupo de Betacoronavírus e que está muito perto de SARS-CoV , responsável por uma epidemia de pneumonia aguda que apareceu em novembro de 2002 na província chinesa de Guangdong e se espalhou para 29 países em 2003. Um total de 8.098 casos foram registrados, incluindo 774 mortes. Sabe-se que os morcegos do gênero Rhinolophus (potencialmente várias espécies de cavernas) foram os reservatório deste vírus e que um pequeno carnívoro, a civeta de palmeira ( Paguma larvata ), pode ter servido como um hospedeiro intermediário entre morcegos e os primeiros casos humanos.

Desde então, muitos Betacoronavírus foram descobertos, principalmente em morcegos, mas também em humanos. Por exemplo, RaTG13, isolado de um morcego da espécie Relacionado a rinolofídeos coletado na província de Yunan da China, foi recentemente descrito como muito semelhante ao SARS-CoV-2, com sequências do genoma idênticas a 96% . Esses resultados indicam que os morcegos, e em determinadas espécies do gênero Rhinolophus , constituem o reservatório dos vírus SARS-CoV e SARS-CoV-2.



Um, Relacionado a rinolofídeos .
Alexandre Hassanin,Autor fornecido

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Mas como você define um reservatório? Um reservatório é uma ou várias espécies animais que não são ou não muito sensíveis ao vírus, que irão hospedar naturalmente um ou vários vírus. A ausência de sintomas da doença é explicada pela eficácia do seu sistema imunológico, que permite lutar contra a proliferação viral excessiva.

Mecanismo de recombinação

Em 7 de fevereiro de 2020, soubemos que um vírus ainda mais próximo do SARS-CoV-2 havia sido descoberto no pangolim. Com 99% de concordância genômica relatada , isso sugere um reservatório mais provável do que os morcegos. No entanto, um estudo recente em revisão mostra que o genoma do coronavírus isolado do pangolim da Malásia ( Manis javanica ) é menos semelhante ao SARS-Cov-2, com apenas 90% de concordância genômica. Isso indicaria que o vírus isolado no pangolim não é responsável pela epidemia de COVID-19 que grassa atualmente.

No entanto, o coronavírus isolado do pangolina é semelhante em 99% em uma região específica da proteína S, que corresponde aos 74 aminoácidos envolvidos no domínio de ligação do receptor ACE (Enzima Conversora da Angiotensina 2), aquele que permite a entrada do vírus células humanas para infectá-los. Em contraste, o vírus RaTG13 isolado de morcego R. relacionado é altamente divergente nesta região específica (apenas 77% de similaridade). Isso significa que o coronavírus isolado do pangolim é capaz de entrar nas células humanas enquanto o isolado do morcego R. relacionado não é.

Além disso, essas comparações genômicas sugerem que o vírus SARS-Cov-2 é o resultado de uma recombinação entre dois vírus diferentes, um próximo ao RaTG13 e outro próximo ao vírus pangolim. Em outras palavras, é uma quimera entre dois vírus pré-existentes.

Um coronavírus do pangolim pode ser uma das fontes de COVID-19.
Wildlife Alliance / Flickr , CC BY

Este mecanismo de recombinação teve já foi descrito em coronavírus, em particular para explicar a origem do SARS-CoV. É importante saber que a recombinação resulta em um novo vírus potencialmente capaz de infectar uma nova espécie de hospedeiro. Para que a recombinação ocorra, os dois vírus divergentes devem ter infectado o mesmo organismo simultaneamente.

Duas questões permanecem sem resposta: em qual organismo essa recombinação ocorreu? (morcego, pangolim ou outra espécie?) E, sobretudo, em que condições essa recombinação aconteceu?


Alexandre Hassanin , Professor Associado (HDR) na Sorbonne University, ISYEB - Instituto de Sistemática, Evolução, Biodiversidade (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Museu Nacional de História Natural (MNHN)

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